圖書信息
內容簡介
對 arXiv q-bio.PE 分類的年度綜述,涵蓋 2025 年 9 月 至 2026 年 8 月 期間發表的研究。本卷基於對 120 篇論文 的細讀整理,組織為 44 章,按該領域的研究子方向描繪這一年的全貌。
全書框架(年度產出佔比):
- 隨機種群動力學與分支過程 (15.7%) — 本子方向聚焦利用隨機過程與分支模型,對具有空間結構與合作繁殖的種群增長、滅絕與固定時間進行建模。
- 進化適應度景觀與自適應動力學 (14.5%) — 本子方向研究適應度、選擇與突變如何塑造遺傳、文化與人工系統中的進化軌跡,包括開放式適應與景觀探索。
- 數據驅動的流行病預測與傳染病建模 (12.6%) — 本子方向發展預測傳染病傳播的機器學習與統計方法,整合異構數據源與數字孿生框架以用於公共衛生應用。
- 生態群落動力學與物種相互作用 (11.6%) — 本子方向考察競爭、擴散與環境異質性如何塑造生態群落結構,包括滅絕閾值、元群落動力學與空間組織。
- 倉室流行病模型與行為反饋 (11.0%) — 本子方向以行為反饋、接種策略與統計力學方法擴展經典 SIR 型模型,以理解流行病動力學與控制干預。
- 演化博弈論與合作機制 (9.6%) — 本子方向利用演化博弈動力學與強化學習框架,探索互惠、懲罰與空間結構如何在社會困境中穩定合作。
- 系統發育推斷與樹空間幾何 (9.2%) — 本子方向發展重建與分析系統發育樹與網絡的算法與幾何方法,包括混合模型、圖神經網絡與譜方法。
- 媒介傳播疾病的傳播與控制 (8.3%) — 本子方向對登革熱與寨卡等媒介傳播疾病的傳播動力學建模,納入空間擴散、接種與經濟-流行病學權衡以制定控制策略。
- 腫瘤免疫動力學與耐藥演化 (4.3%) — 本子方向將數學建模應用於癌症治療、細菌耐藥性與細胞譜系動力學,聚焦優化序貫治療並理解異質性。
- 捕食者-獵物系統與阿利效應 (3.1%) — 本子方向研究帶阿利閾值、隨機擾動與多物種相互作用的捕食者-獵物動力學,包括混沌、滅絕風險與生態管理啟示。
每個子方向均通過三章展開論述——它如何提出自己的問題、其關鍵結論的強度,以及它開放的爭論與前沿,從而讓讀者獲得該領域今年實際產出的可溯源圖景。