图书信息
内容简介
对 arXiv q-bio.PE 分类的年度综述，涵盖 2025 年 9 月 至 2026 年 8 月 期间发表的研究。本卷基于对 120 篇论文 的细读整理，组织为 44 章，按该领域的研究子方向描绘这一年的全貌。
全书框架（年度产出占比）：
- 随机种群动力学与分支过程 (15.7%) — 本子方向聚焦利用随机过程与分支模型，对具有空间结构与合作繁殖的种群增长、灭绝与固定时间进行建模。
- 进化适应度景观与自适应动力学 (14.5%) — 本子方向研究适应度、选择与突变如何塑造遗传、文化与人工系统中的进化轨迹，包括开放式适应与景观探索。
- 数据驱动的流行病预测与传染病建模 (12.6%) — 本子方向发展预测传染病传播的机器学习与统计方法，整合异构数据源与数字孪生框架以用于公共卫生应用。
- 生态群落动力学与物种相互作用 (11.6%) — 本子方向考察竞争、扩散与环境异质性如何塑造生态群落结构，包括灭绝阈值、元群落动力学与空间组织。
- 仓室流行病模型与行为反馈 (11.0%) — 本子方向以行为反馈、接种策略与统计力学方法扩展经典 SIR 型模型，以理解流行病动力学与控制干预。
- 演化博弈论与合作机制 (9.6%) — 本子方向利用演化博弈动力学与强化学习框架，探索互惠、惩罚与空间结构如何在社会困境中稳定合作。
- 系统发育推断与树空间几何 (9.2%) — 本子方向发展重建与分析系统发育树与网络的算法与几何方法，包括混合模型、图神经网络与谱方法。
- 媒介传播疾病的传播与控制 (8.3%) — 本子方向对登革热与寨卡等媒介传播疾病的传播动力学建模，纳入空间扩散、接种与经济-流行病学权衡以制定控制策略。
- 肿瘤免疫动力学与耐药演化 (4.3%) — 本子方向将数学建模应用于癌症治疗、细菌耐药性与细胞谱系动力学，聚焦优化序贯治疗并理解异质性。
- 捕食者-猎物系统与阿利效应 (3.1%) — 本子方向研究带阿利阈值、随机扰动与多物种相互作用的捕食者-猎物动力学，包括混沌、灭绝风险与生态管理启示。
每个子方向均通过三章展开论述——它如何提出自己的问题、其关键结论的强度，以及它开放的争论与前沿，从而让读者获得该领域今年实际产出的可溯源图景。
